首先，國(guó)有土地上的棚戶區(qū)改造程序是要根據(jù)《國(guó)有土地上房屋征收與補(bǔ)償條例》有關(guān)規(guī)定的房屋的征收要符合公共利益的需要，棚戶區(qū)改造的啟動(dòng)程序和先決條件就是四規(guī)劃一計(jì)劃，同時(shí)，基于《國(guó)有土地上房屋征收與補(bǔ)償條例》有關(guān)規(guī)定，制定征收補(bǔ)償方案和及時(shí)公布，并及時(shí)修改補(bǔ)償方案，征收依據(jù)的范圍內(nèi)的聽取被征收人的意見并組織聽證。

其次，進(jìn)行社會(huì)發(fā)展穩(wěn)定市場(chǎng)風(fēng)險(xiǎn)管理評(píng)估后，市、縣級(jí)行政機(jī)關(guān)作出征收決定。涉及人數(shù)較多的根據(jù)《國(guó)有土地上房屋征收與補(bǔ)償條例》有關(guān)規(guī)定，應(yīng)當(dāng)經(jīng)行政機(jī)關(guān)常務(wù)會(huì)議討論決定。這是作出房屋征收決定的決策分析程序，當(dāng)然同時(shí)也是一種法定程序。

最后，要在征收范圍內(nèi)進(jìn)行公告，選擇評(píng)估機(jī)構(gòu)等。對(duì)于集體土地征收的基本程序，房屋征收程序?qū)徟A段，市，縣國(guó)土資源局頒發(fā)的提議征地公告，并與村集體經(jīng)濟(jì)組織和農(nóng)戶，開展地籍調(diào)查和地上附著物的登記并且擬定“一書四方案”組卷上報(bào)審批等。棚戶區(qū)改造原本是一項(xiàng)民心工程，但在現(xiàn)實(shí)生活中，有一些拆遷當(dāng)事人在拆遷過程中沒有按照法律規(guī)定的程序，濫用職權(quán)，損害被拆遷人的利益，導(dǎo)致國(guó)家出臺(tái)的各項(xiàng)政策的效果大大降低。 因此，如果在棚戶區(qū)改造過程中被拆遷人遇到一些拆遷方有違法行為時(shí)，必須敢于用法律武器保護(hù)自己的合法利益，從而有效地保護(hù)自己的切身利益。